Im Mittelpunkt der Arbeit der hauptamtlichen Mitarbeitenden steht die fachliche Betreuung von Schutzgebieten. Die naturschutzfachliche Entwicklung der Gebiete setzt Erhebungen der Tier- und Pflanzenarten sowie die Erfassung von Veränderungen in der Landschaft voraus. Auf Basis dieser Erfassungen entwickelt die Station langfristige, nachhaltige Konzepte zur Erhaltung und Verbesserung der Gebiete. Diese werden direkt durch die Station oder beauftragte Unternehmen umgesetzt und durch regelmäßige Erfolgskontrollen flankiert. Somit arbeitet die Station ganz praktisch für den Schutz seltener und gefährdeter Tier- und Pflanzenarten.
Neben der Betreuung von Naturschutzgebieten und FFH-Gebieten werden vor allem aber auch spezielle Artenschutzprojekte, Öffentlichkeitsarbeit, praktische Pflegemaßnahmen, die Beratung von landwirtschaftlichen Betrieben im Rahmen des Kreiskulturlandschaftsprogramms (KULAP bzw. Vertragsnaturschutz) sowie eine Natur- und Umweltbildung durchgeführt.